根据由发展改革委、科技部、教育部联合制订的这项规划，“十一五”期间国家将重点建设散裂中子源、强磁场装置、大型天文望远镜、海洋科学综合考察船、航空遥感系统、结冰风洞、大陆构造环境监测网络、重大工程材料服役安全研究评价设施、蛋白质科学研究设施、子午工程、地下资源与地震预测极低频电磁探测网、农业生物安全研究设施12项重大科技基础设施。
规划提出，“十一五”期间将在信息、生命科学、空间、海洋、纳米及新材料等战略领域，组建30个左右设施先进、规模效益明显、创新能力强、开放程度高的国家科学中心和国家实验室。在学科交叉广泛和创新日趋活跃的研究领域，建设和完善300个左右国家重点实验室。
“十一五”期间，国家将以加快信息、生物等高技术产业发展，推进国民经济信息化进程，培育产业核心竞争力为目标，在核心电子器件、高端通用芯片、集成电路和软件、下一代网络、新一代无线移动通信、信息安全、重大新药创制、重大传染病防治、现代中药等领域，建设若干支撑产业核心技术研发的设施。
为实现规划提出的目标，国家将加大公共财政对基础性、公益性和战略性研究开发设施的投入；加强国家投资对社会资金的引导；加大政策性金融支持；加大对企业研究开发设施投入的税前抵扣，对进口国内不能生产的研发设施减免关税和进口环节增值税。
