市科信局有关人士介绍，超级计算中心是以超级计算机为基础，面向科研、国民经济、社会发展、高新技术产业等突出问题和核心技术，是着重对准解决普通计算机和服务器不能完成的大型复杂课题而建设的。相对于早期的计算中心而言，它的计算能力有了巨大的飞跃。
据悉，国家超级计算深圳中心，首期将部署每秒千万亿次的超级计算机，其计算能力超过２０万台普通笔记本电脑。如：用一台普通电脑，分析３０年的气象数据需要２０多年，而使用这台千万亿次超级计算机只需１小时；使用一台普通的电脑需要１年才能完成一次汽车碰撞模拟实验，而这台超级计算机不到１５分钟就可以完成。超级计算机主要用在新能源、新材料、自然灾害、气象预报、地质勘探、工业仿真模拟、新药开发、动漫制作、基因排序、城市规划等。此外，对民生发展也有不可替代的作用，譬如外地的空气污染是否会影响到深圳？印度尼西亚的海啸对珠三角有什么影响？这些都可以用超级计算机找到答案。
