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  • DNA生物传感器在“基因诊断”中的实验研究
    http://www.ic72.com 发布时间:2008/1/19 11:28:00

        现有的HBV检测,是通过检测HBV产生的5种抗原蛋白来间接检测HBV,也就是通常所说的“两对半”检测法。但有时由于使用药物得到免疫性结果,使抗原不被表达,通过检测抗原的办法来检测HBV就会产生假阴性的结果。另外,当血液中的HBV消失时,有关的抗原并不能立即消失,这样用“两对半”来检测时,又会产生假阳性的问题。为了克服上述缺陷,我们提出用DNA传感器来直接HBV的设想。据此,开发出特异性好、灵敏度高、寿命长、响应时间短、能重复使用检测HBV的DNA传感器是至关重要的。

        1 传感器的制备

        1. 1  表面处理
      
        本研究采用的石英晶体传感器,其镀金表面在使用前要经过预处理,以除去表面的有机杂质。处理方法是:取AT切石英晶体,先用超声波清洗5min,再用Piranha溶液浸泡30min,最后依次用纯净水、丙酮、无水乙醇、纯净水清洗。N2干燥后测定石英晶体的基频F0。

        1.2   DNA探针的固定

        1.2.1自组装法固定

        探针固定液是将带有已硫醇标记的DNA探针,用0.3MNaC1 pH7.9溶液溶解为10μg/mL,取0.26mL DNA探针固定液,在DNA固定容器中浸泡预处理过的石英晶体1h,然后用纯净水清洗。最后用氮气干燥系统干燥,测定所用石英晶体的频率F1,计算出固定所引起的频率改变量 F0( F0=F1-F0)。所有制备过程均在室温下进行。

        1.2.2   生物素膜法固定
      
        其固定方法是将预处理过的石英晶体,用0.26mL 1mM3.3-二硫丙酸浸泡金表面30min,然后用纯净水清洗,N2干燥系统干燥,测定石英晶体频率F1。再用0.25mL 100mg/mL EDC和5μL 100mg/mL NHS溶液浸泡30min,浸泡后再用纯净水清洗,N2干燥系统干燥,测定石英晶体频率F2。然后依次用0.26mL0.2mg/mL抗生素浸泡90min,0.26mL 1mM2-氨基乙醇(pH=8.0)浸泡60min,0.26mL生物素标记过的DNA探针固定液浸泡60min,用纯净水清洗,N2干燥系统干燥,测定石英晶体频率F3。所有制备过程均在室温下进行。计算固定引起的石英晶体振荡频率改变量 F0( F0=F3-F2)。

        2 传感器的应用

        2.1   样品的处理
     
        血液样品预处理:取回的血液样品先经过离心除去红细胞,离心条件为900转/min,离心5min。然后取上层血清,加入氯仿/苯酚溶液(体积比为血清/溶剂=2/1),静置3min,然后以12000转/min离心5min,除去蛋白,取上层血清作检验血清。

          2.1.2 将制备好的血清样品在水浴锅中99℃变性处理10min。

        变性完成后,立即取0.26mL样品,置于杂交容器中,恒温48.3℃,用前面方法所制备的石英晶体DNA传感器进行杂交检测。杂交时间为60min。用正常血清样品作对照实验,比较检测结果。

        3 讨论
        
        3.1.1  固定量的比较
      
        自组装方法和生物素膜法固定的DNA探针,所引起的石英晶体传感器频率改变量 F0,通过表1进行了对比。

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        从表1中列举的数字来看,用生物素固定后石英晶体频率的改变量其平均值为166.6Hz;用自组装法固定石英晶体频率的改变量其平均值为135.6Hz。生物素膜法固定的量是自组装法固定量的1.2倍。

        3.1.2   稳定性比较

        稳定性是DNA传感器研制中的一个关键参数。只有石英晶体表面固定的DNA能稳定存在,后继的检测工作才能正常进行。稳定性主要是指固定的DNA在恶劣的环境中会不会脱落,例如在强酸或强碱溶液中。为了了解DNA固定的稳定性,将固定好的DNA传感器用1mM/mL HC1溶液或1mM/mLNaOH溶液浸泡4min,然后用纯净水清洗后,氮气干燥,测定浸泡后的晶体频率,计算出浸泡后引起的频率改变量,得出结果见表2、表3。

        表2 1mM/ml HCl溶液浸泡后引起频率改变量对比(Hz)

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        表3   1mM/mL NaOH溶液浸泡后引起频率改变量对比(Hz)

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        注:表中的频率改变量为晶体频率上升的量,负号表示下降。

        从上述两个表中可以看出,用自组装法固定的DNA传感器,在浸泡后频率趋于上升,上升量约为20Hz多。这说明经过强酸或强碱处理后,用自组装法固定在石英晶体表面的DNA发生了脱落。用生物素膜法固定的DNA,在经过上述处理后,其频率改变量很小,表明用此法固定的DNA探针稳定性比较好。

        3.2  血清样品对照检测
        
        3.2.1  取样

        样品由广州军区广州总医院检验科提供,一种是已被免疫法检测出含有高拷贝数的乙肝病毒,另一种是正常人的血液样品,同样也用免疫法检测,证明不含有乙肝病毒。

        3.2.2  检测

        根据前面所讲的样品处理方法,对样品进行处理,取出不含蛋白的血清,在99℃变性处理,使DNA双链解链成为单链,最后在48.3℃条件下,利用固定有乙肝病毒特异性DNA探针的石英晶体传感器定性杂交检测,记录杂交检测所引起的石英晶体DNA传感器频率的下降值,得结果如表4。

        从表4中可以看出,石英晶体DNA传感器可以准确检测出血清样品的乙肝病毒,其频率改变量平均为312.4Hz,变化量很明显,可以用仪器检测出来。

        表4 真实样品的检测结果   (Hz)

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